В первый состав Координационного совета вошли 38 молодых ученых из научных центров и образовательных организаций высшего образования со всей России. Председателем совета стала лауреат Государственной премии Российской Федерации, профессор, доктор исторических наук, главный научный сотрудник Института археологии и этнографии Сибирского отделения РАН Наталья Полосьмак.
С мая 2009 по октябрь 2011 года Координационный совет возглавлял заместитель академика-секретаря Отделения историко-филологических наук РАН, кандидат исторических наук Андрей Петров, с октября 2011 года по июль 2015 года — проректор Воронежского государственного университета, доктор биологических наук, профессор Василий Попов, а с июля 2015 года по июнь 2017 года — директор Института мировой экономики и международных отношений имени Е.М.Примакова РАН, доктор политических наук Федор Войтоловский.
С 2017 года Координационный совет возглавляет руководитель Курчатовского комплекса синхротронно-нейтронных исследований НИЦ «Курчатовский институт», кандидат физико-математических наук Никита Марченков. В настоящее время в состав Координационного совета входят 66 молодых ученых.
Координационный совет по делам молодежи в научной и образовательной сферах является консультативным органом Совета при Президенте Российской Федерации по науке и образованию, образованным в целях обеспечения взаимодействия Совета по науке и образованию с общественными молодежными объединениями и организациями при рассмотрении вопросов, связанных с развитием науки и образования.
Основными задачами Координационного совета являются:
- координация деятельности общественных объединений и организаций молодых ученых, преподавателей, аспирантов и студентов при выработке предложений научно-образовательного сообщества при рассмотрении вопросов развития науки и образования;
- обеспечение взаимодействия Совета по науке и образованию с молодыми учеными и преподавателями, а также общественными объединениями и организациями молодых ученых, преподавателей, специалистов и студентов;
- подготовка предложений Совету по науке и образованию по актуальным вопросам государственной научно-технической политики, государственной политики в области образования, в том числе, касающихся проблем молодых ученых и специалистов в сфере науки и образования, а также вопросов воспроизводства научно-педагогических кадров.